1992-ben az USA-ban megalapították az Alternatív Orvoslás Részlegét, a Nemzeti Egészségügyi Intézetek (NIH - National Institutes of Health) szervezetén belül, az alternatív orvoslás hatékonyságának és biztonságosságának kutatására. 1999-ben ez a hivatal lett a Kiegészítő és Alternatív Orvoslás Nemzeti Központja.
Az alternatív orvoslás kezeléseinek hatékonysága fontos kérdés. Néhány kezelés hatékonynak bizonyult egyes állapotokban, bár ezeket más kórállapotokban is használják. Az alternatív gyógymódok nagy részét azonban még nem vizsgálták ilyen szempontból. A bizonyítékok hiánya ugyanakkor nem jelenti azt, hogy az adott terápia hatástalan, csupán annyit, hogy a hatása még nem bizonyított. Ha egy alternatív terápia hatástalannak bizonyul, alkalmazása a továbbiakban tudományosan nem megalapozott. A legnagyobb kockázatot az jelenti, ha a beteget a jól bevált, hagyományos gyógymód helyett valamely alternatív gyógymóddal kezelik, a statisztika szerint azonban ez ritkán fordul elő.
A biztonságosság a másik fontos szempont. Egyes alternatív terápiák esetleges veszélyt
hordozhatnak magukban. Mivel a gyógyfüvekből készült orvosságokat nem szabályozza az
Élelmiszer és Gyógyszer Ellenőrző Hivatal (FDA - Food and Drug Administration), a
gyártóknak nem kell bizonyítaniuk azok biztonságosságát. 
Az alternatív gyógymódok akkor is okozhatnak kárt, ha tényleges fizikai, vagy egyéb,
nem-kémiai kezelésről van szó. A legtöbb esetben az alternatív orvoslás után kialakult
káros hatást nem állapítják meg, vagy zárják ki, de olykor ez bizonyítható.
